Zutaten zuordnen, Zyklen berechnen, Primer entwerfen — und herausfinden, warum eine PCR manchmal nichts liefert.
Dein Fortschritt:
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Übungsaufgaben
Dreißig Aufgaben, bunt gemischt — zum Klicken, Ziehen, Zuordnen, Rechnen und Knobeln. Jede Übung gibt dir sofort Rückmeldung; bei Schwierigkeiten helfen dir die gestuften Tipps. Die Chips zeigen das Anforderungsniveau: AFB I heißt wiedergeben und direkt anwenden, AFB II heißt selbst entscheiden und verknüpfen, AFB III heißt begründen, beurteilen oder eine Falle durchschauen. Mix verbindet Wissen aus mehreren Unterkapiteln, Trick warnt: Hier steckt eine Falle drin. Der Balken oben zeigt dir, wie viele der 30 Aufgaben du schon gelöst hast.
A1
Zielfragmente nach sieben Zyklen
AFB I
Fassen Sie zusammen das Ergebnis eines Idealfalls mit einem Ausgangsdoppelstrang und sieben Zyklen. Tragen Sie die Zahlen der Doppelstränge und der exakten Zielfragmente ein.
Alle Felder ausfüllen, dann gemeinsam prüfen.
Nach 7 Zyklen gibt es idealisiert Doppelstränge, davon sind exakte Zielfragmente.
Gesamt 2⁷ = 128. Nicht exakt: 2 · 7 = 14 Stränge. Zielfragmente: 128 − 14 = 114. Typischer Fehler: die 14 nicht exakten Stränge nicht abzuziehen.
Die Gesamtzahl ist die Zweierpotenz mit dem Exponenten sieben.
Ziehe von den 128 Doppelsträngen die nicht exakten ab.
A2
Zielfragmente gegen Zyklen
AFB I
Zeichnen Sie die Messpunkte ein. Auf der x-Achse steht die Zyklenzahl, auf der y-Achse die Zahl der Zielfragmente aus einem Ausgangsdoppelstrang.
Bewege die Maus über das Koordinatensystem und klicke, um den Punkt zu setzen. Mit der Tastatur: Tab ins Koordinatensystem, Pfeiltasten bewegen den Cursor, Enter setzt.
Nach 3 Zyklen: 8 − 6 = 2 Zielfragmente. Nach 4 Zyklen: 16 − 8 = 8. Die Zielfragmente nehmen von Zyklus zu Zyklus stark zu. Typischer Fehler: die Zyklenzahl auf die y-Achse zu setzen.
Die Zyklenzahl gehört auf die x-Achse.
Bei 4 Zyklen liest du auf der y-Achse 8 Zielfragmente ab.
A3
Zyklen bis zum Plateau abschätzen
AFB II
Schätzen Sie ab die Zyklenzahl, ab der die Produktmenge einer PCR meist kaum noch steigt. Stellen Sie den Regler auf Ihre Schätzung.
Schiebe den Regler auf deine Schätzung — Pfeiltasten bewegen ihn feiner. Nach dem Prüfen siehst du den Trefferbereich.
10 Zyklen45 Zyklen
Das Plateau beginnt meist nach etwa 25 bis 35 Zyklen, wenn Primer und dNTPs knapp werden und die Polymerase schwächer wird. Typischer Fehler: schon nach 10 Zyklen ein Plateau anzunehmen.
Im Modell bleibt die Menge nach einer Anfangsphase exponentiell, bis Bausteine fehlen.
